MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 5994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017456	CTT	2	6	1	6	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017456	CTA	2	6	27	32	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017456	CA	3	6	43	48	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017456	A	7	7	61	67	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017456	GTT	2	6	76	81	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017456	GTTT	2	8	1751	1758	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017456	TAAA	2	8	1766	1773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017456	TAGT	2	8	1784	1791	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017456	TGG	2	6	1821	1826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017456	TAA	2	6	1878	1883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017456	TGT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017456	AAC	2	6	2011	2016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017456	TTA	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017456	TATTT	2	10	2032	2041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017456	TTAC	2	8	2063	2070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017456	AACT	2	8	2073	2080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017456	GCA	2	6	2105	2110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017456	ATAA	2	8	3274	3281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017456	ATGT	2	8	3282	3289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017456	AGT	2	6	3324	3329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017456	TTG	2	6	3397	3402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017456	ATC	2	6	3443	3448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017456	ATA	2	6	3514	3519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017456	TTTC	2	8	3637	3644	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017456	T	6	6	3667	3672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017456	ATT	2	6	3730	3735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017456	AAC	2	6	3769	3774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017456	TCT	2	6	3782	3787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017456	TCTA	2	8	3794	3801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017456	ATA	2	6	3802	3807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017456	CAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017456	AAT	2	6	3884	3889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017456	A	6	6	3896	3901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017456	A	8	8	3905	3912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017456	TAA	2	6	3913	3918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017456	TAG	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017456	TCT	2	6	3966	3971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017456	AGA	2	6	4028	4033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017456	GAT	2	6	4125	4130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017456	TAA	2	6	4141	4146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017456	ATC	2	6	4150	4155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017456	TTTA	2	8	4217	4224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017456	AGA	2	6	4232	4237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017456	A	6	6	4237	4242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017456	GAT	2	6	4268	4273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017456	T	6	6	4275	4280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017456	AGA	2	6	4298	4303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017456	AGAACA	2	12	4327	4338	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017456	TTA	2	6	4344	4349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017456	AGA	2	6	4393	4398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017456	AT	3	6	4410	4415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017456	TAG	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017456	A	7	7	4428	4434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017456	TAA	2	6	4435	4440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017456	TAA	3	9	4459	4467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017456	CTA	2	6	4490	4495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017456	ATT	2	6	4502	4507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017456	AAT	2	6	4508	4513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017456	A	6	6	4516	4521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017456	AAT	2	6	4532	4537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017456	TAA	2	6	5062	5067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017456	T	6	6	5128	5133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017456	TAA	2	6	7285	7290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017456	ATAA	2	8	7327	7334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017456	TAAAA	2	10	10482	10491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017456	TTAAA	2	10	10540	10549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017456	TTTA	2	8	10972	10979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017456	AT	4	8	11685	11692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017456	TAT	2	6	11703	11708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017456	TTTA	3	12	11720	11731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017456	GAT	2	6	11736	11741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017456	GATG	2	8	11744	11751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017456	TAA	2	6	11803	11808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017456	AT	3	6	12565	12570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017456	AAAGC	2	10	20723	20732	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017456	TAA	2	6	20749	20754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017456	ATTA	2	8	20772	20779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017456	TTAA	2	8	20790	20797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017456	TAGT	2	8	20823	20830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017456	A	6	6	20872	20877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017456	ATC	2	6	20891	20896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017456	TAT	2	6	20911	20916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017456	TTA	2	6	20917	20922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017456	TACT	2	8	20931	20938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017456	TAT	2	6	20939	20944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017456	TCT	2	6	22888	22893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017456	TAT	3	9	22913	22921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017456	GATT	2	8	22933	22940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017456	TTA	2	6	24739	24744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017456	A	6	6	24769	24774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017456	ACA	2	6	24837	24842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017456	A	6	6	25703	25708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017456	A	7	7	25722	25728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017456	TTG	2	6	25769	25774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017456	TA	3	6	26060	26065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017456	T	7	7	26109	26115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017456	ATTT	2	8	26124	26131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017456	ATT	2	6	26135	26140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017456	TAAA	2	8	26145	26152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017456	A	6	6	26150	26155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017456	CAA	2	6	26165	26170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017456	T	6	6	26186	26191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017456	AAT	2	6	28728	28733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017456	AT	3	6	28732	28737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017456	GTTG	2	8	28773	28780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017456	TTG	2	6	28836	28841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017456	TTA	2	6	28864	28869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017456	ATT	2	6	28873	28878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017456	TTA	2	6	28892	28897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017456	CAA	2	6	29430	29435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017456	CAA	2	6	29443	29448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017456	TAT	2	6	29458	29463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017456	CAAT	2	8	29903	29910	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017456	TCA	2	6	29911	29916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017456	CA	3	6	29915	29920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017456	AAT	2	6	31145	31150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017456	CTTG	2	8	31166	31173	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017456	AGT	2	6	31196	31201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017456	A	6	6	33069	33074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017456	ATT	2	6	33097	33102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017456	GGA	2	6	33161	33166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017456	AGG	2	6	33209	33214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017456	TAA	2	6	35979	35984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017456	AAG	2	6	35996	36001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017456	T	6	6	36033	36038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017456	ATA	2	6	36040	36045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017456	TAC	2	6	36075	36080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017456	AT	3	6	36091	36096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017456	ATA	2	6	36157	36162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017456	TAT	2	6	38754	38759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017456	TA	3	6	38784	38789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017456	A	6	6	40148	40153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017456	GGA	2	6	40155	40160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017456	GGT	2	6	40759	40764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017456	TCC	2	6	40805	40810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017456	T	6	6	40957	40962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017456	GC	3	6	41007	41012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017456	TCA	2	6	41036	41041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017456	GCT	2	6	41117	41122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017456	GT	3	6	41148	41153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017456	AGC	2	6	41155	41160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017456	TA	3	6	43652	43657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017456	AGT	2	6	43710	43715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017456	ATTA	2	8	45419	45426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017456	TTCA	2	8	45440	45447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017456	ATT	2	6	45465	45470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017456	TGT	2	6	46572	46577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017456	GATT	2	8	46581	46588	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017456	CAG	2	6	46617	46622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017456	CAT	2	6	46746	46751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017456	AGG	2	6	46789	46794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017456	CTG	2	6	46844	46849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017456	ACA	2	6	46914	46919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017456	TCG	2	6	46968	46973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017456	GGA	2	6	46974	46979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_017456	TA	3	6	47310	47315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017456	AGG	2	6	50046	50051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017456	TTA	2	6	50388	50393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017456	ATA	2	6	50397	50402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_017456	A	6	6	50588	50593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_017456	TA	3	6	50607	50612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_017456	TG	3	6	50672	50677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_017456	TTAA	2	8	50761	50768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017456	TTG	2	6	51685	51690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_017456	T	6	6	51983	51988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_017456	T	6	6	52037	52042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_017456	TAA	2	6	85853	85858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_017456	TGA	2	6	85995	86000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017456	CAT	2	6	86032	86037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_017456	TC	3	6	86060	86065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
291	NC_017456	AG	3	6	86069	86074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
292	NC_017456	A	6	6	86084	86089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_017456	AAT	2	6	86145	86150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_017456	CGC	2	6	103492	103497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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432	NC_017456	TAGT	2	8	103679	103686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_017456	GAA	2	6	106689	106694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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